MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR12

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022601	CCA	2	6	10	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022601	CAA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022601	CAA	2	6	66	71	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
4	NC_022601	GCA	2	6	84	89	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
5	NC_022601	GTT	2	6	93	98	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639097
6	NC_022601	TTA	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639097
7	NC_022601	A	7	7	446	452	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
8	NC_022601	ACG	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
9	NC_022601	AGA	2	6	493	498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639097
10	NC_022601	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
11	NC_022601	A	6	6	582	587	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
12	NC_022601	CAAA	2	8	598	605	75 %	0 %	0 %	25 %	554639097
13	NC_022601	A	6	6	707	712	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
14	NC_022601	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
15	NC_022601	CAT	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639097
16	NC_022601	GA	3	6	770	775	50 %	0 %	50 %	0 %	554639097
17	NC_022601	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
18	NC_022601	CAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
19	NC_022601	GCA	2	6	845	850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
20	NC_022601	AAC	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
21	NC_022601	CA	3	6	1010	1015	50 %	0 %	0 %	50 %	554639097
22	NC_022601	AAC	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
23	NC_022601	AAACC	2	10	1166	1175	60 %	0 %	0 %	40 %	554639097
24	NC_022601	GTT	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022601	TAAAAT	2	12	1488	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022601	TA	3	6	1594	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022601	TTAC	2	8	1638	1645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022601	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022601	TA	3	6	1675	1680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022601	TACT	2	8	1732	1739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022601	TTG	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022601	TTG	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022601	TTG	2	6	1818	1823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022601	TTG	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022601	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022601	T	6	6	1892	1897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022601	AATC	2	8	1922	1929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022601	ATT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022601	T	6	6	1953	1958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022601	AATG	2	8	1969	1976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022601	ACA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639098
42	NC_022601	ATGA	2	8	2021	2028	50 %	25 %	25 %	0 %	554639098
43	NC_022601	ATT	2	6	2151	2156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639098
44	NC_022601	TAA	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
45	NC_022601	A	7	7	2292	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	554639098
46	NC_022601	AACT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	0 %	25 %	554639098
47	NC_022601	AAG	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
48	NC_022601	AGA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
49	NC_022601	A	9	9	2597	2605	100 %	0 %	0 %	0 %	554639098
50	NC_022601	GTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639098
51	NC_022601	AATTT	2	10	2640	2649	40 %	60 %	0 %	0 %	554639098
52	NC_022601	CCT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639098
53	NC_022601	AAT	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
54	NC_022601	T	7	7	2716	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022601	GGT	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022601	AGA	2	6	2825	2830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
57	NC_022601	AGC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639112
58	NC_022601	A	6	6	2838	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
59	NC_022601	TGAT	2	8	2884	2891	25 %	50 %	25 %	0 %	554639112
60	NC_022601	GAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
61	NC_022601	TA	3	6	2944	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	554639112
62	NC_022601	ATA	2	6	2956	2961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
63	NC_022601	AAC	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639112
64	NC_022601	ATCA	2	8	2970	2977	50 %	25 %	0 %	25 %	554639112
65	NC_022601	ATT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
66	NC_022601	TAA	3	9	3089	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
67	NC_022601	GTTA	2	8	3122	3129	25 %	50 %	25 %	0 %	554639112
68	NC_022601	A	8	8	3148	3155	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
69	NC_022601	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
70	NC_022601	AAT	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
71	NC_022601	ATG	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
72	NC_022601	A	6	6	3312	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
73	NC_022601	GAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
74	NC_022601	T	6	6	3360	3365	0 %	100 %	0 %	0 %	554639112
75	NC_022601	A	6	6	3378	3383	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
76	NC_022601	TTAGA	2	10	3394	3403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022601	TAGAT	2	10	3481	3490	40 %	40 %	20 %	0 %	554639099
78	NC_022601	TA	3	6	3514	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	554639099
79	NC_022601	A	6	6	3558	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	554639099
80	NC_022601	CAG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639099
81	NC_022601	AAC	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
82	NC_022601	TTC	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639099
83	NC_022601	AAC	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
84	NC_022601	CAAT	2	8	3757	3764	50 %	25 %	0 %	25 %	554639099
85	NC_022601	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639099
86	NC_022601	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022601	ATTA	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022601	ATG	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022601	T	6	6	3973	3978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022601	TAAAA	2	10	3993	4002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022601	GCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639100
92	NC_022601	GTGC	2	8	4192	4199	0 %	25 %	50 %	25 %	554639100
93	NC_022601	ACC	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639100
94	NC_022601	AAT	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639100
95	NC_022601	T	7	7	4377	4383	0 %	100 %	0 %	0 %	554639100
96	NC_022601	GAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639100
97	NC_022601	TTTAA	2	10	4427	4436	40 %	60 %	0 %	0 %	554639100
98	NC_022601	A	6	6	4526	4531	100 %	0 %	0 %	0 %	554639100
99	NC_022601	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639100
100	NC_022601	CTCTC	2	10	4588	4597	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_022601	GGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022601	A	7	7	4658	4664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022601	TAG	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022601	T	6	6	4732	4737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022601	A	7	7	4765	4771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022601	AGG	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022601	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
108	NC_022601	A	8	8	4825	4832	100 %	0 %	0 %	0 %	554639101
109	NC_022601	TC	3	6	4833	4838	0 %	50 %	0 %	50 %	554639101
110	NC_022601	TCA	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639101
111	NC_022601	CAG	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639101
112	NC_022601	CA	3	6	4933	4938	50 %	0 %	0 %	50 %	554639101
113	NC_022601	AGT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
114	NC_022601	AGT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
115	NC_022601	GAA	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
116	NC_022601	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
117	NC_022601	TCT	3	9	5039	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
118	NC_022601	ATCT	2	8	5073	5080	25 %	50 %	0 %	25 %	554639101
119	NC_022601	CTG	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639101
120	NC_022601	TTC	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
121	NC_022601	ATTA	2	8	5192	5199	50 %	50 %	0 %	0 %	554639101
122	NC_022601	GAT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
123	NC_022601	AGA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
124	NC_022601	GGA	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639101
125	NC_022601	GGT	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639101
126	NC_022601	CA	3	6	5374	5379	50 %	0 %	0 %	50 %	554639101
127	NC_022601	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
128	NC_022601	A	8	8	5458	5465	100 %	0 %	0 %	0 %	554639101
129	NC_022601	AGA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
130	NC_022601	AGT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
131	NC_022601	ACA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639101
132	NC_022601	A	6	6	5673	5678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022601	CTT	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022601	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022601	TA	3	6	5712	5717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022601	TTA	3	9	5721	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022601	ACC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639102
138	NC_022601	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
139	NC_022601	AAT	2	6	5878	5883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
140	NC_022601	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	554639102
141	NC_022601	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
142	NC_022601	AGC	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639102
143	NC_022601	AAG	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
144	NC_022601	TAAA	2	8	6239	6246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022601	AAT	2	6	6291	6296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
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165	NC_022601	TAG	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_022601	A	6	6	7157	7162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_022601	AAG	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_022601	AAT	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639105
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217	NC_022601	CAAT	2	8	8783	8790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_022601	A	6	6	10887	10892	100 %	0 %	0 %	0 %	554639108
273	NC_022601	TCC	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_022601	ATAG	2	8	10932	10939	50 %	25 %	25 %	0 %	554639109
275	NC_022601	A	7	7	10956	10962	100 %	0 %	0 %	0 %	554639109
276	NC_022601	TAA	2	6	11001	11006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639109
277	NC_022601	ACT	2	6	11007	11012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639109
278	NC_022601	T	7	7	11045	11051	0 %	100 %	0 %	0 %	554639109
279	NC_022601	A	6	6	11052	11057	100 %	0 %	0 %	0 %	554639109
280	NC_022601	AC	3	6	11115	11120	50 %	0 %	0 %	50 %	554639109
281	NC_022601	A	6	6	11146	11151	100 %	0 %	0 %	0 %	554639109
282	NC_022601	GGA	2	6	11162	11167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639109
283	NC_022601	T	7	7	11210	11216	0 %	100 %	0 %	0 %	554639109
284	NC_022601	ATTT	2	8	11221	11228	25 %	75 %	0 %	0 %	554639109
285	NC_022601	T	6	6	11226	11231	0 %	100 %	0 %	0 %	554639109
286	NC_022601	TCACC	2	10	11290	11299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
287	NC_022601	GTA	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022601	TAT	2	6	11372	11377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022601	A	6	6	11437	11442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022601	GGA	2	6	11453	11458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_022601	GAA	2	6	11565	11570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639110
292	NC_022601	A	6	6	11592	11597	100 %	0 %	0 %	0 %	554639110
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296	NC_022601	GGA	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639110
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303	NC_022601	A	6	6	12046	12051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_022601	A	6	6	12114	12119	100 %	0 %	0 %	0 %	554639113
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309	NC_022601	CAA	2	6	12219	12224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639113
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311	NC_022601	GA	3	6	12374	12379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022601	GA	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_022601	CG	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
314	NC_022601	CAA	2	6	12606	12611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.